cpDNA region | CK | MD | B | D | TL | Li | LF | K2i | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Variable position | 88 | 107-126 | 77 | 78 | 82 | 168 | 196 | 197 | 206 | 154 | 157 | 115 | 133 | 114 | ||||
Position total | 424 | 443 - 462 | 629 | 630 | 634 | 834 | 872 | 873 | 882 | 1081 | 1084 | 1279 | 1297 | 1464 | Seq. length | Rel. freq. | ||
Extant haplotypes | ||||||||||||||||||
Ht1. | √ | √ | C | 12A + 5G | A | A | C | G | T | C | G | T | C | T | T | C | 1551 | 0.103 |
Ht2. | √ | √ | C | 11A + 6G | A | A | C | G | T | C | G | T | C | A | T | C | 1551 | 0.259 |
Ht3. | √ | √ | C | 11A + 6G | C | A | C | G | T | C | G | T | C | A | T | C | 1551 | 0.103 |
Ht4. | √ | √ | C | 10A + 6G | A | A | C | G | T | C | G | T | A | A | T | T | 1550 | 0.017 |
Ht5. | √ | √ | C | 13A + 5G | A | A | C | G | T | C | G | T | C | A | T | C | 1552 | 0.034 |
Ht6. | √ | √ | C | 12A + 5G | C | A | C | G | T | C | G | T | C | A | T | C | 1551 | 0.034 |
Ht7. | √ | √ | C | 10A + 6G | A | A | C | G | T | C | G | T | C | A | T | C | 1550 | 0.017 |
Ht8. | √ | √ | C | 12A + 5G | A | A | C | G | T | C | G | T | C | A | T | C | 1551 | 0.379 |
Ht9. | √ | √ | T | 12A + 4G + 3A + G | A | C | T | G | T | A | G | C | C | A | G | C | 1554 | 0.017 |
Macrofossil haplotypes | ||||||||||||||||||
Cone | √ | C | A | C | G | T | C | G | A | T | C | 901 | ||||||
S 3. | A | A | C | 124 | ||||||||||||||
S 4. | T | A | 237 | |||||||||||||||
S 8. | √ | C | A | C | G | T | C | G | 575 | |||||||||
S 9. | √ | C | 10A + 7GA + 7G | G | T | C | G | A | T | C | 990 | |||||||
S 10. | √ | A | A | C | G | T | A | G | T | C | C | 1016 | ||||||
S 502-S 545 | C | 12A + 5G | 211 | |||||||||||||||
Fossil pollen haplotypes | ||||||||||||||||||
P1. | C | 10A + 6G | 212 | |||||||||||||||
P2-P3. | C | A | C | 124 | ||||||||||||||
P4-P11. | G | T | C | G | 251 | |||||||||||||
P12. | G | T | A | G | 251 | |||||||||||||
P13. | G | G | A | G | 251 | |||||||||||||
P14-P15. | √ | 136 | ||||||||||||||||
P16-P17. | √ | 200 |