Skip to main content

Table 1 The mtOrt model

From: MtOrt: an empirical mitochondrial amino acid substitution model for evolutionary studies of Orthoptera insects

  

Ala

Arg

Asn

Asp

Cys

Gln

Glu

Gly

His

Ile

Leu

Lys

Met

Phe

Pro

Ser

Thr

Trp

Tyr

Val

Exchangeability rates

Ala

                    

Arg

0.04

                   

Asn

0.03

0.22

                  

Asp

0.14

0.09

6.01

                 

Cys

0.64

1.63

0.57

0.24

                

Gln

0.09

3.01

1.44

0.30

0.25

               

Glu

0.20

0.03

1.64

10.55

0.25

2.50

              

Gly

1.05

0.21

0.69

1.13

1.25

0.08

1.24

             

His

0.07

1.43

2.55

0.46

0.24

5.73

0.12

0.08

            

Ile

0.08

0.04

0.44

0.05

0.28

0.05

0.06

0.04

0.10

           

Leu

0.06

0.07

0.07

0.02

0.28

0.23

0.05

0.03

0.14

1.59

          

Lys

0.00

1.43

3.95

0.13

0.00

3.98

3.33

0.13

0.25

0.08

0.07

         

Met

0.41

0.02

0.43

0.05

0.27

0.25

0.29

0.17

0.14

2.95

3.98

0.80

        

Phe

0.06

0.00

0.12

0.02

1.50

0.06

0.07

0.09

0.17

1.00

2.16

0.03

0.63

       

Pro

0.52

0.42

0.27

0.06

0.00

0.95

0.11

0.01

0.73

0.07

0.29

0.43

0.07

0.08

      

Ser

3.26

0.25

2.51

0.49

4.04

0.45

0.57

2.47

0.20

0.18

0.45

3.04

0.75

0.62

1.51

     

Thr

4.04

0.09

1.77

0.07

0.34

0.15

0.24

0.03

0.24

2.14

0.27

0.71

3.35

0.09

1.11

3.91

    

Trp

0.03

1.21

0.10

0.19

2.09

0.01

0.18

0.25

0.02

0.07

0.42

0.32

0.21

0.52

0.06

0.34

0.02

   

Tyr

0.02

0.22

1.44

0.41

3.73

0.75

0.27

0.09

4.15

0.17

0.21

0.39

0.30

3.90

0.22

0.52

0.13

0.78

  

Va

2.31

0.06

0.09

0.13

1.69

0.01

0.32

0.54

0.00

9.41

0.84

0.05

2.49

0.66

0.08

0.38

1.51

0.14

0.16

 

Amino acid frequencies

 

0.04

0.01

0.06

0.02

0.01

0.02

0.02

0.04

0.01

0.11

0.16

0.03

0.09

0.09

0.03

0.10

0.06

0.02

0.05

0.05